1997年10月、核磁気共鳴装置（NMR）を中心とした最先端の分析機器メーカーであるBRUKER（ブルカー社）がX線分析において歴史と実績を兼ね備えたSiemens Analytical X-ray Systems（シーメンス社 X線分析装置部門）を買収し、BrukerAXS（ブルカー・エイエックスエス）を設立しました。

この買収に伴い、日本国内でも同年日本ブルカーがX線回折装置の販売を開始し、2000年8月　日本ブルカーからX線装置販売部門が分離し、日本ブルカー・エイエックスエス株式会社を設立しました（2002年6月に現在のブルカー・エイエックスエス株式会社と社名変更）。

2002年5月　BrukerAXSは、日本のX線回折装置メーカである株式会社マック・サイエンスの営業権を取得しました。これにより日本国内での基盤を大きく強化するに至りました。旧マック・サイエンスの開発・製造部門は、全世界の BrukerAXS に強力X線源等を供給する重要製造拠点の一つとして活動しています。また、サービス部門も大きく強化され、お客様がご安心して装置をお使いいただける環境が整っております。

ブルカー・エイエックスエス（X線技術本部）は、弊社X線回折装置ユーザーおよび既存の日本ブルカーX線回折装置ユーザー、マック・サイエンスX線回折装置ユーザーのサポートだけではなく、常に世界最高水準の最先端技術をつぎ込んだ装置を開発・製造するとともに、アプリケーションの開発を通じ、お客様の問題を解決するソリューションを提供することを活動義務としています。

また、ブルカー・エイエックスエス（X線営業本部）は、日本国内のライフサイエンス、物質工学、材料科学等の最先端科学の研究に取り組む企業や研究機関に世界最高クラスのX線回折装置、単結晶X線構造解析装置、蛍光X線分析装置、マイクロアナリシス等を提案・販売しております。